Compete ao Conselho Pedagógico a coordenação e orientação educativa da Escola, nomeadamente nos domínios pedagógico-didáctico, da orientação e acompanhamento dos alunos e da formação inicial e contínua do pessoal docente e não docente. Este órgão é composto por dezoito membros: Presidente do Conselho Executivo, oito coordenadores dos departamentos curriculares, coordenador dos projectos de desenvolvimento educativo, dois coordenadores de ciclo, coordenador pedagógico do ensino recorrente, representante dos Serviços Especializados de Apoio Educativo, representante da Associação de Pais e Encarregados de Educação, representante dos alunos do ensino secundário e representante do pessoal não docente.
Presidente: Professor António Orlando da Silva Pereira